Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTG1Q9NSN8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms