Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP13A2Q9NQ11 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms