Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD3Q9H7E2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD3Q9H7E2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD3Q9H7E2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD3Q9H7E2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD3Q9H7E2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD3Q9H7E2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TDRD3Q9H7E2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD3Q9H7E2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD3Q9H7E2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD3Q9H7E2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD3Q9H7E2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD3Q9H7E2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD3Q9H7E2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD3Q9H7E2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD3Q9H7E2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD3Q9H7E2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD3Q9H7E2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD3Q9H7E2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD3Q9H7E2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD3Q9H7E2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD3Q9H7E2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD3Q9H7E2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD3Q9H7E2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD3Q9H7E2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD3Q9H7E2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD3Q9H7E2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD3Q9H7E2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TDRD3Q9H7E2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms