Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EHD4Q9H223 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms