Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NYXQ9GZU5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NYXQ9GZU5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms