Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZC3H12CQ9C0D7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZC3H12CQ9C0D7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZC3H12CQ9C0D7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZC3H12CQ9C0D7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZC3H12CQ9C0D7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZC3H12CQ9C0D7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZC3H12CQ9C0D7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZC3H12CQ9C0D7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZC3H12CQ9C0D7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZC3H12CQ9C0D7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZC3H12CQ9C0D7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZC3H12CQ9C0D7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZC3H12CQ9C0D7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZC3H12CQ9C0D7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZC3H12CQ9C0D7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZC3H12CQ9C0D7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZC3H12CQ9C0D7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZC3H12CQ9C0D7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZC3H12CQ9C0D7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZC3H12CQ9C0D7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZC3H12CQ9C0D7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZC3H12CQ9C0D7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZC3H12CQ9C0D7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZC3H12CQ9C0D7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZC3H12CQ9C0D7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZC3H12CQ9C0D7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZC3H12CQ9C0D7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZC3H12CQ9C0D7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZC3H12CQ9C0D7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC3H12CQ9C0D7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms