Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRP1Q9C000 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NLRP1Q9C000 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms