Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VN1R3Q9BXE9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms