Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms