Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
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