Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE5

AGMAT, Agmatinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGMATQ9BSE5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGMATQ9BSE5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGMATQ9BSE5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGMATQ9BSE5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGMATQ9BSE5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGMATQ9BSE5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGMATQ9BSE5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGMATQ9BSE5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGMATQ9BSE5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGMATQ9BSE5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AGMATQ9BSE5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AGMATQ9BSE5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AGMATQ9BSE5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGMATQ9BSE5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGMATQ9BSE5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGMATQ9BSE5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGMATQ9BSE5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGMATQ9BSE5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGMATQ9BSE5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AGMATQ9BSE5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGMATQ9BSE5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGMATQ9BSE5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGMATQ9BSE5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGMATQ9BSE5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGMATQ9BSE5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGMATQ9BSE5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGMATQ9BSE5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGMATQ9BSE5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGMATQ9BSE5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGMATQ9BSE5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGMATQ9BSE5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AGMATQ9BSE5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGMATQ9BSE5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGMATQ9BSE5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms