Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
DUSP9Q99956 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms