Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EYA3Q99504 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EYA3Q99504 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms