Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PHF12Q96QT6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms