Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms