Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC7Q96M83 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms