Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC17Q96LX7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC17Q96LX7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms