Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf72Q96LT7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms