Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCHS1Q96JQ0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms