Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LIN37Q96GY3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms