Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms