Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF428Q96B54 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF428Q96B54 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms