Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCC1Q92922 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCC1Q92922 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms