Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF4BQ92750 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF4BQ92750 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF4BQ92750 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF4BQ92750 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF4BQ92750 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF4BQ92750 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF4BQ92750 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TAF4BQ92750 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TAF4BQ92750 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TAF4BQ92750 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TAF4BQ92750 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TAF4BQ92750 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms