Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALLDQ8WX93 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALLDQ8WX93 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms