Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARMIL3Q8ND23 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms