Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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