Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AVL9Q8NBF6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
AVL9Q8NBF6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
AVL9Q8NBF6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AVL9Q8NBF6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AVL9Q8NBF6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AVL9Q8NBF6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AVL9Q8NBF6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AVL9Q8NBF6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AVL9Q8NBF6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AVL9Q8NBF6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AVL9Q8NBF6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AVL9Q8NBF6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AVL9Q8NBF6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AVL9Q8NBF6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
AVL9Q8NBF6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
AVL9Q8NBF6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AVL9Q8NBF6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AVL9Q8NBF6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AVL9Q8NBF6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
AVL9Q8NBF6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AVL9Q8NBF6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AVL9Q8NBF6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AVL9Q8NBF6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AVL9Q8NBF6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AVL9Q8NBF6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AVL9Q8NBF6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AVL9Q8NBF6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AVL9Q8NBF6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AVL9Q8NBF6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AVL9Q8NBF6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AVL9Q8NBF6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AVL9Q8NBF6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms