Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNBD1Q8NA66 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNBD1Q8NA66 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms