Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC2Q8N158 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms