Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX29P2Q8IUI4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms