Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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