Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSX7Q7RTT5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms