Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDZRN4Q6ZMN7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms