Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms