Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SDE2Q6IQ49 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SDE2Q6IQ49 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms