Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
VIRMAQ69YN4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VIRMAQ69YN4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VIRMAQ69YN4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VIRMAQ69YN4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VIRMAQ69YN4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VIRMAQ69YN4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VIRMAQ69YN4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VIRMAQ69YN4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VIRMAQ69YN4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VIRMAQ69YN4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VIRMAQ69YN4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms