Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
INTS3Q68E01 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
INTS3Q68E01 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms