Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREB3L3Q68CJ9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CREB3L3Q68CJ9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms