Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VSD8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VSD8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VSD8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VSD8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VSD8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VSD8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VSD8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VSD8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VSD8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VSD8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VSD8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VSD8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VSD8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VSD8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VSD8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VSD8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VSD8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VSD8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VSD8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VSD8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VSD8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VSD8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VSD8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VSD8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VSD8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VSD8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VSD8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VSD8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms