Protein–RNA interactions for Protein: Q5TH69

ARFGEF3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF3Q5TH69 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGEF3Q5TH69 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms