Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BEND3Q5T5X7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BEND3Q5T5X7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms