Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCID2Q5JVF3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCID2Q5JVF3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCID2Q5JVF3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCID2Q5JVF3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCID2Q5JVF3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCID2Q5JVF3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCID2Q5JVF3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCID2Q5JVF3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCID2Q5JVF3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCID2Q5JVF3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms