Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms