Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ODF2Q5BJF6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ODF2Q5BJF6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms