Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD55Q3KP44 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms