Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODF4Q2M2E3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF4Q2M2E3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF4Q2M2E3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF4Q2M2E3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF4Q2M2E3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF4Q2M2E3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF4Q2M2E3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF4Q2M2E3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF4Q2M2E3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF4Q2M2E3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF4Q2M2E3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF4Q2M2E3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF4Q2M2E3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF4Q2M2E3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF4Q2M2E3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF4Q2M2E3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF4Q2M2E3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF4Q2M2E3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF4Q2M2E3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF4Q2M2E3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF4Q2M2E3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF4Q2M2E3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF4Q2M2E3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF4Q2M2E3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF4Q2M2E3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms