Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC142Q17RM4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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