Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRNQ16849 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRNQ16849 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRNQ16849 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRNQ16849 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRNQ16849 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRNQ16849 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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PTPRNQ16849 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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PTPRNQ16849 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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PTPRNQ16849 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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PTPRNQ16849 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRNQ16849 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRNQ16849 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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PTPRNQ16849 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRNQ16849 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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PTPRNQ16849 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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PTPRNQ16849 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRNQ16849 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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