Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTN1Q16799 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTN1Q16799 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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